1979’da İstanbul’da doğdu. Getronagan Ermeni Lisesi’ni ve Boğaziçi Üniversitesi Sosyoloji Bölümü’nü bitirdi. New York Üniversitesi’nde Ortadoğu–İslam Çalışmaları ve Tarih bölümlerinde yaptığı doktorasını 2010’da tamamladı. Michigan Üniversitesi’ndeki Ermeni Çalışmaları Kürsüsü’nde bir yıllık Manoogian Doktora Sonrası Araştırma Bursu’nu aldı. Melissa Bilal ile birlikte, 2006’da yayımlanan Bir Adalet Feryadı: Osmanlı’dan Türkiye’ye Beş Ermeni Feminist Yazar (1862–1933) kitabının editörlüğünü yaptı. Şu anda, yine Melissa Bilal ile birlikte, 1860–1960 tarihlerinde, on iki öncü kadının hayatı ve çalışmalarını merceğe alan “Feminism in Armenian: An Interpretive Anthology and Digital Archive” başlıklı bir kitap ve dijital beşeri bilimler projesi üzerine çalışıyor. Ekmekçioğlu, Massachusetts Teknoloji Enstitisü’nde McMillan–Stewart Tarih doçenti ve Kadın ve Cinsiyet Etütleri Programı üyesi.